L'Agence coordonne le réseau de l'enseignement français à l'étranger (EFE), constitué d'établissements scolaires homologués par l'Éducation nationale française. Elle structure ce réseau en seize zones,  avec un institut régional de formation (IRF) dans chacune des zones.

Elle pilote l'emploi des concours humains et financiers apportés par l’État au fonctionnement des établissements d'enseignement français à l’étranger, avec l'objectif stratégique de développer ce réseau, en suivant le « Cap 2030 » fixé par le président de la République (objectif de doublement, entre 2018 et 2030, des effectifs d'élèves scolarisés dans le réseau de l'enseignement français à l'étranger).

Elle recrute, rémunère et accompagne les personnels titulaires de l’Éducation nationale (environ 6 500 personnes) qu'elle affecte aux établissements dont elle a la gestion directe (68) ou qui lui sont associés par une convention (161). Elle n'affecte pas de personnels dans les établissements partenaires (351) mais inclut ces établissements dans le fonctionnement du réseau, principalement grâce aux dispositifs de formation des personnels. En effet, l'AEFE mène une ambitieuse politique de formation au bénéfice de tous les personnels de l'ensemble du réseau, notamment les personnels sous contrat local recrutés directement par les établissements.

Elle met en œuvre au profit des établissements du réseau une politique pédagogique qui conjugue respect des programmes scolaires en vigueur en France et des valeurs qui sous-tendent le système éducatif français, éducation plurilingue, ouverture à la langue et à la culture du pays d'accueil. Elle développe des dispositifs communs, fondés sur des principes humanistes et inclusifs, qui renforcent les atouts de l'enseignement français dans un contexte international.
 

L'Agence propose des projets et des événements fédérateurs aux établissements du réseau. Elle relaie et appuie des projets éducatifs initiés par ces établissements scolaires.

Elle alloue des moyens aux zones des instituts régionaux de formation permettant l'affectation aux établissements de subventions de fonctionnement, d’investissement, d’équipement et d’appui pédagogique.

Elle apporte à des familles françaises une aide à la scolarité sous forme de bourses scolaires. Elle accorde des bourses France Excellence-Major aux plus brillants des élèves étrangers désireux de poursuivre leurs études supérieures en France.

Implanté dans 139 pays, le réseau de 580 établissements (données de 2023) coordonné par l’AEFE constitue un atout incontestable pour les entreprises françaises présentes à l’international et pour le développement de l’attractivité de la France.

En développant et en renforçant la diplomatie éducative, le réseau des établissements d’enseignement français à l’étranger soutient la diplomatie culturelle et économique française.
 

L'Agence fournit une ingénierie dans les domaines de la pédagogie, de l'orientation scolaire et professionnelle, de l'immobilier, des ressources humaines, de la gestion et de la gouvernance, de la sécurité et de la communication.

Elle peut apporter des prestations d'expertise à des porteurs de projets qui veulent développer un enseignement conforme au modèle éducatif français.

Chapitre du code de l'éducation sur L'Agence pour l'enseignement français à l'étranger (articles L452-1 à L452-10)