Afin de créer des initiatives conjointes aux établissements et toujours plus "faire réseau" mais aussi pour amplifier les communications qui seront menées sur les actions innovantes réalisées en établissements, l'AEFE a décidé de définir des années thématiques pouvant être un fil conducteur pour l'Agence et pour les établissements qui souhaitent s'y inscrire. 

L'AEFE et le réseau d'enseignement français à l'étranger (EFE) que l'Agence coordonne sont des acteurs majeurs de la promotion de la langue française et du plurilinguisme. Alors que la France a accueilli le 4 octobre 2024 le XIXe Sommet de la Francophonie, l'AEFE a fait de l'année scolaire 2024-2025 dans le réseau une Année de la francophonie.

De nombreuses thématiques ont guidé les activités de l'AEFE et des établissements du réseau. Parmi les années thématiques récentes : 

• 2023-2024 : Année du sport
• 2022-2023 : Année de l'éducation aux médias et à l'information
• 2022-2021 : Année de l'éducation au développement durable

Les principaux événements et initiatives fortes portées par l'AEFE s'inscrivent dans ces thématiques annuelles, destinées à créer une dynamique commune en valorisant un axe éducatif d'importance. À cette occasion, l'Agence met à disposition de tous les établissements du réseau des kits de communication adaptés.